Hebron University Journal - Hebron University Journal for Research - Volume 2, Issue 2, 2006 - Comparative Analyses of the Coat Protein of Newly Discovered Ampelovirus Using Computer-Assisted Phylogenetic Reconstruction and Analysis: (An Approach for Classification and Characterization)

Hebron University Research Journal

Review

Written by Hebron University
Abstract:
The coat protein of the newly found closteroviruses Grapevine leafroll associated virrus 9 (GLRaV-9) was used for comparative analysis with other members of the family Closteroviridae. The amino acid alignments using ClustalW demonstrated a significant
homology between the GLRaV-9 sequence and the Grapevine leafroll associated virus 5 (86%) and Pineapple mealybug wilt-associated virus-1 (56%). GLRaV-9 and GLRaV-5 were proved to be serologically distinct by using GCG sequence analysis software
package that indicate the significant variation (26%) within their polypeptide sequences at the N-terminus of their coat protein. The phylogenetic analysis, grouped GLRaV-9 with mealybug transmitted viruses (GLRaV-1, -3, -5, and PMWaV-1, -2), suggesting the
mode of the transmission of this newly found closterovirus.
 

الملخص:

 البروتين المغلَف للفيروس المكتشف حديثا والمسمى (Grapevine leafroll associated virus 9) قد تم استخدامه في دراسة تحليلية على أساس المقارنة مع أفراد من العائلة (Closteroviridae) . اصطفاف الأحماض الأمينية باستخدام (ClustalW) أظهرت تماثل ملحوظ بين المتتالية للفيروس (GLRaV-9),virus 5  Grapevine leafroll associatedبنسبة (86%)وكذلك (Pineapple mealybug wilt-associted virus-1) بنسبة (56%) . لقد تم اثبات ان GLRaV-9وGLRaV-5هما مصليا غير ذي صلة وذلك باستخدام رزمة برامج للعقل الالكتروني لتحليل المتتالية والتي تشير الى اختلاف ذو معنى (26%) لمتتالية الأحماض الأمينية للبروتين المغلَف لتلك الفيروسات . أما باستخدام تحليل التاريخ العرقي فقد وجد أن (GLRaV-9) يتجمع مع الفيروسات الناقلة بواسطة حشرة البقة المغبرة-1GLRaV-1, -3,-5 and – PMWaV-1, -2) مما يوحي بالكيفية التي ينتقل بها هذا الفيروس الحديث الاكتشاف . 

Copyright © 2018 Hebron University. All Rights Reserved.