يقع حرم جامعة الخليل الرئيسي على منطقة جبلية شمال غرب المدينة، ويغطي مساحة54 دونم. وقد تم تشييد معظم ابنية الجامعة من التبرعات والرعايات التي تم الحصول عليها من فلسطين والخارج، وهذا الأمر في حد ذاته يمثل جوهر نجاح الجامعة، وانعكاسا لثقة المانحين وايمانهم برسالتها.

ويضم الحرم الجامعي خمس مبان رئيسية وهي: مبنى الشيخ محمد علي الجعبري الذي شيد في عام 1971, ويحوي قاعات تدريسية وكلية الشريعة وفرع البنك ومكاتب إدارية مثل العلاقات العامة، دائرة الموارد البشرية، الدائرة المالية، عمادة القبول والتسجيل، مكتب المشاريع ومكتب رئيس الجامعة.

تم بناء مبنى الملك فيصل للعلوم والتكنولوجيا بمنحة من البنك الإسلامي للتنمية - المملكة العربية السعودية. ويضم المبنى قاعات تدريسية ومختبرات لكليات العلوم والتمريض وكذلك كلية التمويل والإدارة وكلية التربية والدراسات العليا ومركز الإعلام وكافتيريا تشغل الطابق الأرضي.

اما عن مبنى عمر بن الخطاب فقد تم تمويله جزئيا من قبل الدكتور مانع العتيبي، وزير البترول السابق في دولة الإمارات العربية المتحدة. ويضم كل من كلية الآداب والزراعة بالإضافة الى مكتبة الجامعة الرئيسية والقاعات التدريسية التابعة للكليات.

أما بالنسبة الى مبنى ياسر عرفات فانه يحوي كليات الحقوق والعلوم السياسية والصيدلة والعلوم الطبية, مركز مصادر اللغة الفرنسية، مركز التعليم الإلكتروني، مركز التميز، عمادة شؤون الطلبة، مقهى الجامعة، كافتيريا الجامعة، المسرح وقاعة الألعاب الرياضية.

وفيما يتعلق بمبنى الدراسات الاستراتيجية فانه يحتضن الأنشطة الخاصة بالمؤتمرات والندوات وهو يضم أيضا المكاتب الخاصة بمجلس الأمناء.